도쿠가와 이에야스, 히데타다, 이에미츠 삼대 장군의 귀의를 받은 아마미 승정와 도도 다카토라는 겐나 2년(1616)에 위독했던 도쿠가와 이에야스에게 불려 세 사람의 영혼이 오래도록 함께 머무를 수 있는 곳을 만들어 달라는 유언을 받았습니다. 아마미 승정은 도도 다카토라의 저택지인 현재의 우에노 공원의 땅을 받아 도에이잔 간에이지를 세우고 경내에 많은 가람과 자원을 건립했습니다. 그중 하나로 간에이 4년(1627)에 도쇼구의 전신인 ‘도쇼샤’가 창건되었습니다. 그 후에 도쇼샤는 쇼호 3년(1646)에 조정으로부터 정식으로 궁호를 받아 ‘도쇼구’가 되었습니다. 현존하는 본전은 게이안 4년(1651)에 삼대장군 도쿠가와 이에미츠가 재건한 것으로, 겐나 3년(1617) 닛코에 건립된 도쇼구를 참배할 수 없는 에도 사람들을 위해 닛코 도쇼구에 준하는 단장을 했다고 전해집니다. 우에노의 산을 전쟁터로 구 막부군과 신 정부군이 싸운, 게이오 4년(1868)의 보신전쟁의 하나인 우에노 전쟁으로 인해 간에이지를 비롯한 많은 가람과 자원이 소실되었지만 우에노 도쇼구까지는 불길이 미치지 않았고, 다이쇼 4년(1923)에 일어난 관동대 지진과 이후의 전쟁에서도 붕괴를 면하여 오늘날까지 당시의 모습을 간직하고 있습니다.