現在的上野恩賜公園，始建于設立江戶幕府之後的1625年(寬永2)，由慈眼大師天海大僧正創建的東叡山寬永寺的廣闊寺廟領地之上。德川秀忠和家光的皈依之後，在位于江戶城的鬼門(東北)方向的上野台地上修建了寬永寺，它作爲將軍家的祈禱寺・菩提寺深受庇護，在其廣闊的寺廟領地上，有出自小堀遠州等人之手的名園，有清水觀音堂、不忍池辯天堂、舊寬永寺五重塔、開山堂(兩大師)、大佛殿等伽藍林立，還有由各位大名捐獻修建的三十六坊(現存十九坊)小寺院。寒松院就是其中之一，寺名是用奠基的津(地名，現日本三重縣津市)藩主藤堂高虎的法名命名的。津藩(藤堂家)本來計劃在從上野動物園到上野東照宮一帶建造另宅別院，但最終藤堂高虎在這片土地上修建了祭奠家康用的上野東照宮，並捐獻出來，後來在1627年(寬永4)修建了寒松院作爲東照宮的經營管理寺院。在上野動物園裏，現在仍然留存著騰堂家的墓地(非公開)。
　寬永寺的大部分伽藍，都在1868年(明治元年)的戊辰戰爭(又稱上野戰爭)中被燒毀。1870年(明治3)政府任命荷蘭軍醫博杜恩視察之後，根據他的提案在該遺址上修建了日本第一個公園，因此博杜恩被尊稱爲上野恩賜公園的誕生之父，爲了表彰其功績于1973年(昭和48)在上野公園內修建了博杜恩博士像。有趣的是當時的雕像是按照博杜恩的兄弟的照片做成的，在後來的很長一段時間裏竟沒有人察覺這個誤會，直到2006年(平成18)才按照博杜恩本人的照片重新做了雕像。