国立科学博物馆日本馆(旧本馆)的平面是个巨大的飞机，建筑设计成飞机的形状，到场者从正面搭乘，去成为一名探访科学的乘务员。旧馆长室的桌子上，留有原来旧本馆的蓝图。平成16年(2004) 旧本馆因为改装而闭馆，平成19年(2007)4月作为日本馆改装再开，现在仍然保留着创立当时的样子。

　国立科学博物馆最早在明治10年(1877) 作为[教育用博物馆] 开设在上野山里。后来迁移到了汤岛，关东大地震时所有设施和标本都被烧毁了。到了昭和5年(1930)，在现在的地方上重新建设了上野新馆。昭和24年(1949)改名为“国立科学博物馆”，直到现在，这座以新古典主义风格建造的日本馆(旧本馆)里，到处都留有昭和5年落成时的装饰特色。